More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0103 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
272 aa  540  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
272 aa  540  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.12 
 
 
267 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.42 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.42 
 
 
262 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.39 
 
 
262 aa  397  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  72.69 
 
 
263 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.69 
 
 
263 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.26 
 
 
263 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.53 
 
 
260 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
263 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  66.67 
 
 
263 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.02 
 
 
263 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.12 
 
 
260 aa  334  9e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  58.23 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.5 
 
 
259 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 
259 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.37 
 
 
261 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  38.1 
 
 
252 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
259 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  32.6 
 
 
284 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.25 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
301 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 
259 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 
259 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  32.49 
 
 
262 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
278 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  29.6 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.21 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  32.74 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  32.14 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.7 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  32.49 
 
 
262 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  27.78 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
579 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.61 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.26 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  28.92 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  29.94 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.76 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  29.68 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  25.15 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
564 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  30.97 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.48 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 
221 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
732 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
303 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
298 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.49 
 
 
225 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  28.31 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
551 aa  62  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  24.59 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
556 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.9 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.9 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.9 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 
362 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>