More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0831 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  99.61 
 
 
259 aa  507  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  52.67 
 
 
265 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  53.97 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  54.12 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  54.58 
 
 
265 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.9 
 
 
261 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.9 
 
 
265 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.72 
 
 
268 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.05 
 
 
266 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.25 
 
 
264 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.9 
 
 
264 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.9 
 
 
264 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.33 
 
 
261 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  51.39 
 
 
262 aa  254  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.94 
 
 
261 aa  251  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.46 
 
 
264 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  53.04 
 
 
262 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
574 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  29.96 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
272 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  25.97 
 
 
272 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
262 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
261 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 
262 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.58 
 
 
267 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 
262 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  32.91 
 
 
252 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  27.07 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
260 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
287 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.83 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.56 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
258 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
258 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
271 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  25.5 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  26.05 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.77 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.13 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148364  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.84 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.44 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.12 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.16 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.61 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  22.58 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  29.86 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.57 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1872  ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331419  normal  0.27167 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.52 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4792  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, membrane component PhnV  26.11 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000863136  hitchhiker  0.00000359721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  26.76 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  27.01 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.27 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  26.42 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5068  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, membrane component PhnV  27.84 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  0.570016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.61 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  23.85 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.52 
 
 
587 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.11 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
579 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  26.17 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  24.32 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  23.83 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>