More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7383 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7383  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
285 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  40.3 
 
 
263 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
301 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
261 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
263 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1109  spermidine/putrescine ABC transporter permease II  42.15 
 
 
284 aa  159  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0409124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
258 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
258 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3328  hypothetical protein  42.58 
 
 
252 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118723  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
259 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268957  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
259 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
262 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
252 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.725166  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
258 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0348  ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
263 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
263 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170233  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
271 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0113  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  36.9 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0103  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.310677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
263 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
262 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.11 
 
 
260 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
260 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  34.12 
 
 
283 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
259 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.44 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  28.62 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.04 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  27.98 
 
 
265 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  29.3 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  24.17 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  26.54 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  24.17 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  27.6 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  30.34 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.97 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
574 aa  65.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.88 
 
 
226 aa  59.3  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
231 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.23 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  28.57 
 
 
226 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.45 
 
 
221 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  33.52 
 
 
226 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3493  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.49 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3480  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  28.49 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3543  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.49 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  26.96 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.81 
 
 
232 aa  57  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12426  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysW  27.49 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0014023  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3873  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.57 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.204437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.26 
 
 
281 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  29.78 
 
 
410 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.26 
 
 
281 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
298 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.38 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0758947  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  28.32 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
602 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>