More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1659 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  96.13 
 
 
310 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.79 
 
 
307 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.46 
 
 
307 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.86 
 
 
307 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.02 
 
 
301 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.73 
 
 
312 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.31 
 
 
280 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63 
 
 
280 aa  312  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.63 
 
 
291 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174626  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0757  ABC transporter, permease protein  60.73 
 
 
280 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.931203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0807  ABC transporter, permease protein  60.36 
 
 
280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5508  ABC transporter membrane spanning protein  63.14 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07130  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II  60.91 
 
 
290 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.12 
 
 
295 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.57 
 
 
270 aa  263  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.5 
 
 
306 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
268 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
264 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  31.38 
 
 
264 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
270 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
275 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  27.72 
 
 
266 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.42 
 
 
280 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  27.54 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  28.41 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
264 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  27.35 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  32.97 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
316 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  29.03 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  28.89 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.93964  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.52 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  28.69 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
596 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  31.53 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.69 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  28.69 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  28.69 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.69 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
280 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
276 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
265 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
265 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
272 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.25 
 
 
244 aa  92.4  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  28.91 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2399  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.58 
 
 
271 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00651767  normal  0.388943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.72 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.88 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  28.43 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.15 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.08 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
587 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
266 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
269 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  27.31 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
268 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
588 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.69 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  28.19 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  29.7 
 
 
266 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  30 
 
 
269 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 
266 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>