More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0521 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 
301 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.33 
 
 
307 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.33 
 
 
307 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  50.95 
 
 
310 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.37 
 
 
307 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.57 
 
 
307 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.57 
 
 
307 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.57 
 
 
307 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 
280 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
312 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
280 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174626  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07130  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II  51.46 
 
 
290 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396184  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0757  ABC transporter, permease protein  48.09 
 
 
280 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.931203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0807  ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 
280 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.98 
 
 
295 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5508  ABC transporter membrane spanning protein  48.8 
 
 
280 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
260 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
263 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  29.57 
 
 
266 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  29.57 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  29.5 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  28.4 
 
 
266 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  28.02 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  25.87 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  31.46 
 
 
256 aa  92  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  30.99 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.02 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  27.87 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124345  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
298 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2058  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 
278 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.650732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
278 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.260813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2450  putative spermidine/putrescine ABC transporter permease  27.18 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2156  ABC transporter, inner membrane subunit  30.94 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.225733  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  30 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.37 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.93964  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  29.52 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  29.05 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.71 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  31.87 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  28.02 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372706  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2121  putative spermidine/putrescine transport system permease protein  28.12 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  25.78 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
280 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0526069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
593 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  28.23 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.14 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  29.19 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.11 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319859  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  26.47 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  31.98 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  25.55 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1585  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.9 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  26.1 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>