More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3135 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 285 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.67 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.67 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.67 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.93 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  0.45751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.65 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.42 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  41.49 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.91 
 
 		 279 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1012  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  45.24 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  40.89 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 267 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  40.49 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  40.49 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  40.49 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  40.49 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  40.49 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  39.1 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  38.87 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  39.25 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  41.35 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  40.69 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  40.96 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  40.26 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  42.5 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  40.17 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.56 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  37.07 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242595  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  37.07 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  38.27 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.8 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  38.27 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  40 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  40 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  36.93 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2004  Ornithine carbamoyltransferase  38.67 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  37.01 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.33 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 		 185 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3038  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.08 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  35.56 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.1 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  39.39 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  37.45 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  37.1 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.47 
 
 		 254 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  35.1 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  35.48 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  35.48 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.47 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  39.83 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.607638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  36.07 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  37.69 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.91 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.91 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.49 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747095  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4708  Ornithine carbamoyltransferase  41.18 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.91 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  35.6 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  35.66 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  38.03 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.13 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.04 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.76 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.02 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1033  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.34 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1014  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.34 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0953  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.34 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>