More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4754 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
264 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  62.36 
 
 
262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.44 
 
 
262 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0287  ABC transporter permease  52.45 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  45.45 
 
 
269 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0130  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II  50 
 
 
293 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.26 
 
 
266 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 
266 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.102972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
267 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2398  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  50.84 
 
 
266 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
266 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  44.69 
 
 
266 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  44.69 
 
 
266 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  44.69 
 
 
266 aa  215  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  44.69 
 
 
266 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
266 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  44.64 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  44.79 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  45.56 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  43.78 
 
 
266 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  45.83 
 
 
288 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  46.32 
 
 
273 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.18 
 
 
264 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  44.73 
 
 
273 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.41 
 
 
278 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  40.98 
 
 
293 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
273 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  46.61 
 
 
244 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 
259 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 
259 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  44.73 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  44.75 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  44.29 
 
 
256 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  40.55 
 
 
260 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.83 
 
 
256 aa  198  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1580  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.59 
 
 
284 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  43.44 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  39.42 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  44.39 
 
 
272 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  40.25 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.66 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0085  ABC transporter, permease protein  42.59 
 
 
284 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.39 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  39.85 
 
 
276 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
287 aa  194  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
261 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.44 
 
 
270 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  41.32 
 
 
289 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.88 
 
 
256 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.61 
 
 
273 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
272 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
281 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  40.8 
 
 
284 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
272 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.91 
 
 
256 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.08 
 
 
281 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.08 
 
 
281 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.08 
 
 
281 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
259 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  45.29 
 
 
258 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
264 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  42.68 
 
 
274 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.84 
 
 
267 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
272 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1014  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.06 
 
 
281 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  40.68 
 
 
256 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
275 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1033  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.06 
 
 
281 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  40.68 
 
 
256 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0953  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.06 
 
 
281 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1648  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.92 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.256197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0985  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.06 
 
 
281 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.47 
 
 
256 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  42.29 
 
 
272 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
266 aa  188  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.8 
 
 
257 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39 
 
 
257 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
261 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
264 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  38.61 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2284  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.54 
 
 
281 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.408593  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  43.05 
 
 
264 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.56 
 
 
254 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  38.8 
 
 
275 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0395  polyamine transport protein PotI  37.11 
 
 
289 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4708  Ornithine carbamoyltransferase  43.44 
 
 
258 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0199227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
271 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
271 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
271 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
271 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.977673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
271 aa  185  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0917  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.06 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>