More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0283 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
274 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.14 
 
 
277 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1012  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  66.27 
 
 
262 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.78 
 
 
282 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.44 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  0.45751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.45 
 
 
284 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372706  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.27 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.27 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.27 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.14 
 
 
279 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
267 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
285 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.87 
 
 
185 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  40.49 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
289 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
266 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  39.68 
 
 
266 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  39.68 
 
 
266 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  39.68 
 
 
266 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  39.68 
 
 
266 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
266 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  40.49 
 
 
266 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
266 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  43.64 
 
 
256 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  43.22 
 
 
256 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
259 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40 
 
 
254 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 
268 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
261 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.49 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  42.39 
 
 
273 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  36.26 
 
 
286 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 
276 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.76 
 
 
258 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  41.56 
 
 
273 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  39.92 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  38.8 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  36.22 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.4 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  37.11 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.96 
 
 
257 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.37 
 
 
256 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  39.83 
 
 
287 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.22 
 
 
256 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.76 
 
 
256 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  39.51 
 
 
260 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  39.26 
 
 
273 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  41.25 
 
 
288 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.4 
 
 
262 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.41 
 
 
270 aa  168  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3038  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
267 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
267 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548577  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
271 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  36.23 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.39 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
267 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  39.36 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
271 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.88 
 
 
266 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
271 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  41.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  41.15 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.6 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
281 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  38.68 
 
 
272 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
271 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
272 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  38.74 
 
 
272 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
264 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  37.79 
 
 
271 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  37.79 
 
 
271 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  37.79 
 
 
271 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
260 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  37.79 
 
 
271 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  39.74 
 
 
260 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
273 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  36.78 
 
 
271 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
257 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  38.49 
 
 
266 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  37.86 
 
 
271 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  38.29 
 
 
262 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
275 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.09 
 
 
264 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>