More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4850 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009672  Oant_4850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242595  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3038  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  68.94 
 
 		 267 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.94 
 
 		 267 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.05 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  38.08 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  37.04 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  37.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  37.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  37.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  37.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  36.96 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  37.35 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  38.13 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  40.51 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  37.8 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  39.3 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  42.25 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.86 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 		 257 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  37.84 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  38.91 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.16 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  38.91 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  37.35 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  42.74 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.55 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  37.69 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.09 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.65 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  42.31 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.16 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  38.17 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.25 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  37.3 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  36.7 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  38.17 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.88 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.5 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  35.98 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  37.74 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  38.13 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  37.92 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.35 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.9 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  39.92 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.99 
 
 		 244 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.5 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.5 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  36.43 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.5 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  36.4 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  39.23 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  39.23 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  32.2 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  36.05 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  34.9 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  38.27 
 
 		 289 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>