More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4282 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.35 
 
 
301 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  80.45 
 
 
310 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.73 
 
 
307 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.21 
 
 
307 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.73 
 
 
307 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.73 
 
 
307 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.47 
 
 
307 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.09 
 
 
307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 
280 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0757  ABC transporter, permease protein  64.49 
 
 
280 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.931203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0807  ABC transporter, permease protein  64.13 
 
 
280 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.87 
 
 
280 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.55 
 
 
291 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174626  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5508  ABC transporter membrane spanning protein  64.71 
 
 
280 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07130  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II  62.55 
 
 
290 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.46 
 
 
295 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
270 aa  265  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.32 
 
 
306 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
263 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
262 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
596 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
275 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
270 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
268 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
272 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  28.74 
 
 
284 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
268 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  26.67 
 
 
264 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
264 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  30.85 
 
 
264 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.43 
 
 
280 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.66 
 
 
244 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  33.68 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.11 
 
 
264 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
283 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.93964  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
269 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  31.5 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
270 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
265 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00977235  normal  0.387076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
269 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  26.94 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  29.41 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2665  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  32.6 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0357719  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  31.73 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.53 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
266 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  30.94 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  27.2 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2399  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.6 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00651767  normal  0.388943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.49 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  28.03 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7452  ABC transporter membrane spanning protein  31.07 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
588 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  29.51 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
278 aa  92.8  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 
264 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
264 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
284 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 
293 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
597 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.74 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
272 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  27.08 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
264 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.27 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.15 
 
 
241 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.67 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.86 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  29.44 
 
 
265 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
275 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.776443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  28.93 
 
 
266 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  32.63 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  29.02 
 
 
270 aa  89.4  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  26.54 
 
 
286 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
282 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 
269 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>