More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0180 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.93964  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.78 
 
 
270 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 
268 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7452  ABC transporter membrane spanning protein  32.3 
 
 
271 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5611  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.96 
 
 
269 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
275 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.415654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  31.56 
 
 
288 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2450  putative spermidine/putrescine ABC transporter permease  28.46 
 
 
278 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
289 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2058  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 
278 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.650732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
278 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.260813  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  27.91 
 
 
264 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
264 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
277 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
264 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
606 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
591 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0689786  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
550 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957073  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.11 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  29.95 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
284 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  29.15 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
268 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
261 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367092  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
307 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
265 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2399  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.65 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00651767  normal  0.388943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.15 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  27.08 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
307 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
307 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
307 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07130  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II  28.88 
 
 
290 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396184  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.15 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.09 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2665  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  26.73 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0357719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  27.94 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174626  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
274 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
264 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0474626  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2634  Fis family transcriptional regulator  28.85 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  26.32 
 
 
266 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
276 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282406  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.494716  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703183  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.66 
 
 
268 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1886  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0261044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
276 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.64 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.64 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.64 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.64 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  23.55 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  28.57 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.58 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1684  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  28.72 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>