More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1418 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.965906  normal  0.767737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0418  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.24 
 
 
283 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  41.61 
 
 
275 aa  228  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
275 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 
275 aa  225  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
661 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824137  normal  0.513217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
280 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
283 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
279 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
278 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
278 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.917211  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16640  ABC-type sugar transport system, permease component  39.53 
 
 
266 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.9 
 
 
297 aa  195  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
282 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
275 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
279 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
253 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
273 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
279 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
277 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
277 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
281 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
277 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
296 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
296 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 
293 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
280 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
275 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
293 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
275 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
316 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
281 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
295 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
285 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  34.52 
 
 
279 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
285 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
280 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
276 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
273 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.74 
 
 
280 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
280 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
280 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  35.74 
 
 
280 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
273 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
280 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
280 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
286 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
275 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  37.93 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
283 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
276 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000857111  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
286 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
299 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
293 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
316 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
287 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  31.27 
 
 
293 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
281 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.19 
 
 
278 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
276 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
255 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
277 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
277 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
285 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
289 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
279 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
282 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
272 aa  168  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
285 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36.86 
 
 
272 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6239  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  37.12 
 
 
286 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
272 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
275 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
311 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
277 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.09 
 
 
275 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>