More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2292 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.09 
 
 
272 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072806  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.38 
 
 
277 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
277 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
273 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
278 aa  188  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
278 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
276 aa  185  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
275 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.86 
 
 
283 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
276 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
279 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
275 aa  178  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
276 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
274 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
277 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
277 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
283 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
277 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
299 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
281 aa  175  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
322 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
280 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
293 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
282 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.76 
 
 
275 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.21 
 
 
297 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
277 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
275 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
275 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
316 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595578 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
275 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
281 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
286 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
277 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
297 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216679  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 
275 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.76 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
280 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
281 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0418  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.3 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
253 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
316 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
295 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.04 
 
 
283 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
299 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.965906  normal  0.767737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
281 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
273 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
281 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
279 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
279 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
277 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
288 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
289 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
288 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
255 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
294 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
278 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
275 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 
280 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
275 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
279 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
305 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.13 
 
 
301 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
294 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.69 
 
 
278 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  36.5 
 
 
275 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
285 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
296 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
293 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
293 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  0.943286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  32.52 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
296 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  32.42 
 
 
279 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
276 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
283 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
278 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
272 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
275 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>