More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4059 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.965906  normal  0.767737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0418  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  94.31 
 
 
283 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.66 
 
 
283 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  60.85 
 
 
275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  60.5 
 
 
275 aa  335  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.64 
 
 
275 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
276 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16640  ABC-type sugar transport system, permease component  40.53 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
280 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
661 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824137  normal  0.513217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
277 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
275 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
289 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
285 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
297 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.917211  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
253 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
279 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
285 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
292 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
277 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
291 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
291 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
276 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
277 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
279 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  30.83 
 
 
279 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.8 
 
 
275 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
283 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
283 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
278 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
278 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
289 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
274 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.08 
 
 
297 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
285 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
288 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
299 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
293 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
278 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
293 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
305 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
280 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
285 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6239  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  35.27 
 
 
286 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
404 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
282 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
316 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
275 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
404 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
289 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
299 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
284 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 
295 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
301 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
281 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
277 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
281 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
291 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
276 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
280 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
282 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
299 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
278 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
297 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
281 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
299 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
298 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
276 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
285 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210049  normal  0.0503947 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>