More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1027 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.82 
 
 
276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.12 
 
 
279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.15 
 
 
275 aa  299  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
285 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
271 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1617  putative binding-protein-dependent transport protein  34.93 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201797  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.66 
 
 
276 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
271 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
284 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.63 
 
 
295 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
284 aa  175  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.27 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.828471  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
294 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
276 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0127547  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
296 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
275 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
283 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
299 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
303 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
296 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 
275 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
297 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
283 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  32.2 
 
 
303 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
300 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.93 
 
 
297 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
282 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
275 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
279 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.82 
 
 
278 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
275 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
299 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2347  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
299 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
275 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
279 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
275 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
277 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  30.32 
 
 
286 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  36.5 
 
 
277 aa  152  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
275 aa  151  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
290 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
299 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
301 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
274 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3987  putative sugar ABC transporter (permease protein)  32.12 
 
 
282 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
280 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
275 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
275 aa  148  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
278 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  31.58 
 
 
292 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
295 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
283 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
298 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
293 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
279 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.98 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
289 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
280 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
281 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
297 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
322 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
277 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1058  MalG-type ABC sugar transport system permease component  31.27 
 
 
277 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
288 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  32.21 
 
 
295 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.2 
 
 
284 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
287 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
277 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
279 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
390 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 
276 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
274 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
284 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
276 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>