More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6526 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.35 
 
 
288 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.3 
 
 
287 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.57 
 
 
287 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226447  normal  0.796816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.2 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.3 
 
 
287 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
306 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3840  permease protein of sugar ABC transporter  43.4 
 
 
257 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0859974  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
275 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
269 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0193279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  39.31 
 
 
278 aa  178  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
279 aa  175  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
277 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
275 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
275 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
276 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
276 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
275 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 
278 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
246 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
297 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
277 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
277 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.8 
 
 
278 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3104  ABC transporter, permease component  38.31 
 
 
292 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
294 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
293 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
296 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
295 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
293 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.65 
 
 
275 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3392  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.92 
 
 
278 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196448  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.74 
 
 
276 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
299 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
281 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.98 
 
 
277 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
275 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
296 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
281 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
282 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.47 
 
 
283 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
290 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
274 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
279 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  36.4 
 
 
293 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.3 
 
 
283 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
275 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
280 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
294 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
280 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
290 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
278 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
277 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  38.78 
 
 
278 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 
276 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
275 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
277 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
294 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
285 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  39.22 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
291 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
287 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
291 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 
292 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  35.62 
 
 
306 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.59 
 
 
279 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
290 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
285 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
316 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
285 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397277  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  37.6 
 
 
277 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
277 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
275 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
277 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
283 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
305 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
285 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
292 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
253 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
283 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
309 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
273 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
280 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
301 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
276 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
322 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  33.7 
 
 
278 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>