More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3620 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.17 
 
 
287 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.58 
 
 
287 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226447  normal  0.796816 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.3 
 
 
289 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.05 
 
 
288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0193279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3840  permease protein of sugar ABC transporter  43.22 
 
 
257 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0859974  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
275 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
306 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.55 
 
 
283 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
293 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
293 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
283 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
285 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
295 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.11 
 
 
297 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.05 
 
 
281 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
279 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
275 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
282 aa  161  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.54 
 
 
279 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
279 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
322 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
246 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
275 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
288 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
277 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.29 
 
 
275 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
277 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
289 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.65 
 
 
278 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
276 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
275 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
291 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
291 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
276 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
296 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
277 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
275 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
296 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
275 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  39.52 
 
 
276 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.61 
 
 
278 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
294 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
295 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
282 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
285 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
292 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
305 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
287 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.79 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
273 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
298 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
268 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
281 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
294 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
253 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 
271 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
271 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.69 
 
 
277 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.19 
 
 
275 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
277 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
276 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  36.17 
 
 
277 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  36.46 
 
 
290 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
311 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
277 aa  151  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
277 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
275 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
292 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
280 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
275 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.08 
 
 
275 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
316 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
274 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 
269 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
284 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
273 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
271 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
277 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
273 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
305 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.66 
 
 
302 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
275 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
277 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397277  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  39.02 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
281 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
280 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
309 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
296 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>