More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0350 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
297 aa  587  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.95 
 
 
316 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  55.2 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  57.75 
 
 
283 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  55.51 
 
 
292 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.41 
 
 
306 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.51 
 
 
311 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
293 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
293 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
295 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
277 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.28 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
275 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
277 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
279 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
275 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
299 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
277 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
285 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
280 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
280 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
280 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 
280 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
289 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
296 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  38.23 
 
 
333 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
283 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
322 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
283 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
280 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
277 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
291 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
291 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.41 
 
 
280 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
280 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
280 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  37.41 
 
 
280 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
280 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
280 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
297 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
281 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
276 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
281 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.08 
 
 
283 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
278 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
279 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
292 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
288 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
288 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
279 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
279 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
300 aa  162  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
275 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
295 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
303 aa  162  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
295 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  38.41 
 
 
291 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
287 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
270 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  33.08 
 
 
279 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
317 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.52 
 
 
319 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
281 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
277 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
283 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
253 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
288 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
279 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
307 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
270 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
289 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
275 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
305 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>