More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
283 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.95 
 
 
316 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  62.01 
 
 
278 aa  350  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  60 
 
 
292 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.34 
 
 
297 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
311 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
293 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.14 
 
 
295 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
277 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
275 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
277 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
279 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
277 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
277 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
280 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
275 aa  188  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
870 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
283 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
277 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.23 
 
 
277 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
280 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
280 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
276 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.92 
 
 
297 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
279 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
279 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
287 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
283 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
289 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
280 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
281 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
280 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
289 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
746 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
296 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
280 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
280 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
288 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
297 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  34.95 
 
 
305 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
280 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
270 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.38 
 
 
275 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  32.82 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  34.5 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
279 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
833 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
282 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
833 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
277 aa  161  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
294 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
307 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
280 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
304 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
276 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
294 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
288 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.02 
 
 
298 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
277 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
275 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
275 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
278 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
793 aa  158  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
823 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
276 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
823 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
278 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
278 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>