More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2678 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.27 
 
 
279 aa  348  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.91 
 
 
279 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 
253 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.76 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
289 aa  208  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
293 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
293 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.21 
 
 
295 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
280 aa  195  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
277 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
297 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216679  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
275 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
285 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
275 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
276 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
280 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
282 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
280 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
296 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
281 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.38 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  38.38 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
291 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
291 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
275 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  35.52 
 
 
275 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
292 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
306 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
283 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.19 
 
 
283 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
285 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2548  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.19 
 
 
304 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00362276  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
297 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
281 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
316 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.99 
 
 
278 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
281 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0418  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.03 
 
 
283 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4119  ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0396939  normal  0.542053 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
299 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
281 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.965906  normal  0.767737 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3582  hypothetical protein  33.21 
 
 
278 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.928396  normal  0.804079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
303 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265009  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
277 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
283 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
286 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  32.95 
 
 
291 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
283 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
271 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
297 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
275 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
283 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  36.32 
 
 
279 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
281 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
279 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
277 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
281 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
296 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
274 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
276 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
277 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
278 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
278 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
277 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
275 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
283 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.02 
 
 
319 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
287 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
275 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
277 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
310 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
324 aa  152  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
283 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  33.55 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
285 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16640  ABC-type sugar transport system, permease component  35.21 
 
 
266 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
305 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
298 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
280 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>