More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0750 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  99.27 
 
 
275 aa  544  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.45 
 
 
275 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.85 
 
 
281 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.965906  normal  0.767737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0418  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  60.5 
 
 
283 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.79 
 
 
283 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
276 aa  224  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
279 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16640  ABC-type sugar transport system, permease component  36.33 
 
 
266 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
299 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
285 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210049  normal  0.0503947 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
282 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
283 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6239  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  37.55 
 
 
286 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
285 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
285 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
297 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.917211  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
289 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
285 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
275 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
276 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
276 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
277 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
280 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
277 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
280 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
282 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
278 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
277 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
661 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824137  normal  0.513217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
287 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
276 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
283 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
870 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
278 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
275 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
283 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.345018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
281 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
294 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
292 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
289 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.83 
 
 
280 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
297 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.09 
 
 
302 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
277 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 
275 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
277 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
312 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
279 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
289 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.7 
 
 
277 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 
297 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
278 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
274 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
281 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
253 aa  145  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
280 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
276 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
276 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
404 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
281 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
404 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
285 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  33.46 
 
 
272 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
306 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
279 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
296 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
276 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
273 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.25 
 
 
278 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3556  putative ABC transporter permease protein  31.87 
 
 
302 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.27 
 
 
283 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
277 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
292 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
294 aa  143  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
306 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
285 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7335  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.89 
 
 
280 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0398278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
280 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
307 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
278 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
285 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  29.93 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>