More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0623 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  565  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.9 
 
 
298 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
279 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
281 aa  228  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
279 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
276 aa  228  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00701283  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 
279 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
279 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
279 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
279 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
279 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
279 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
279 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
283 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
296 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
273 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
279 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
288 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  40.15 
 
 
303 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.67 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  39.36 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  39.05 
 
 
301 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  38.99 
 
 
281 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
314 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
271 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
279 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
281 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
284 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
271 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
284 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 
281 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
276 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
283 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.41 
 
 
277 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
283 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 
291 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
298 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
275 aa  185  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.46 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  35.88 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  39.38 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.43 
 
 
275 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  39.45 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
294 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
303 aa  181  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  39.02 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
272 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
294 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
275 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  38.15 
 
 
272 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
275 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
270 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.82 
 
 
312 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 
271 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
271 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.6 
 
 
276 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.828471  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  39.78 
 
 
284 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.89 
 
 
275 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
275 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
275 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.64 
 
 
304 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  41.59 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6549  sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
293 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.31 
 
 
295 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  39.2 
 
 
281 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
280 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
272 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.691915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
275 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  35.79 
 
 
293 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
282 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
285 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  35.85 
 
 
280 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>