More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1308 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  544  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.39 
 
 
276 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
271 aa  238  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.691915  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00860  ABC-type sugar transport system, permease component  44.39 
 
 
267 aa  195  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
281 aa  191  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
294 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
294 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.364527  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1494  MalG-type ABC sugar transport system permease component  36.78 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
284 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
285 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
274 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.159934  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
304 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
303 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36.72 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
275 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
272 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
283 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
283 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  36.33 
 
 
273 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
294 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
275 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
296 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
271 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
280 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
293 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 
277 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  33.21 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
298 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
279 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
282 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  31.18 
 
 
291 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  31.6 
 
 
303 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
273 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.61 
 
 
304 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
277 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
297 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.91 
 
 
315 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
282 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
275 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
276 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
282 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
275 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
303 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
283 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
296 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.391762  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.09 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0223274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  34.59 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2413  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.75 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
300 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
283 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
275 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
278 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 
303 aa  146  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
299 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.08 
 
 
297 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
284 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.73 
 
 
275 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
276 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.45 
 
 
278 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
276 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
280 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.59 
 
 
301 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
279 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
284 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3987  putative sugar ABC transporter (permease protein)  32.56 
 
 
282 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
299 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>