More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0628 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  553  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  51.16 
 
 
291 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
283 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  42.75 
 
 
283 aa  248  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  43.95 
 
 
283 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  43.95 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
283 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
289 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
283 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  44.76 
 
 
284 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
283 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
283 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
283 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
283 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
283 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
283 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
283 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
283 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
283 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
283 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
283 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
282 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
282 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
286 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
299 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
294 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
304 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
307 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
294 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
305 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
303 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
280 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
314 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
290 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
279 aa  175  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
290 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
285 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
271 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
274 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
277 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
290 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
292 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
277 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.84 
 
 
293 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.94 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
306 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.530616  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
303 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
300 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00104892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 
295 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
284 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
281 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
284 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
270 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
281 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
269 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
276 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
305 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
277 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
300 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
326 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
273 aa  156  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.44 
 
 
281 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  32.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
279 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  32.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  32.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  32.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  32.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  32.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
273 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
295 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.44 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
387 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.363139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
281 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
270 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
279 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
277 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
284 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  32.98 
 
 
308 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
285 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.82 
 
 
285 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
285 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
285 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
300 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
313 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
285 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  33.08 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
387 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387993  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
292 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  33.08 
 
 
281 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
277 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
280 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 
285 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>