More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3381 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.86 
 
 
307 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.82 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.32 
 
 
305 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.32 
 
 
303 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
314 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
286 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  35.43 
 
 
291 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
289 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
283 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  35.07 
 
 
283 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
283 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
283 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
294 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
283 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
283 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
283 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
294 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
280 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  35.29 
 
 
284 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
283 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
283 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
283 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
283 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
283 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
284 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
292 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
288 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
285 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
277 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
271 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
319 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  30.58 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
320 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
313 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  30.89 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
296 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.391762  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
315 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.07 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.500307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
276 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
281 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
277 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
302 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
292 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
290 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 
285 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
309 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.228391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
290 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
279 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  27.27 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
314 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
284 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.53 
 
 
300 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
277 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
303 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
273 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal  0.0704722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
298 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
270 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.86 
 
 
293 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
297 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2413  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.78 
 
 
277 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
301 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  31.77 
 
 
281 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
287 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544041  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
285 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
275 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
290 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  30.34 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.8 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  32.5 
 
 
281 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  28.24 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>