More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0830 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.65 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  98.6 
 
 
285 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.95 
 
 
285 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.95 
 
 
285 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.95 
 
 
285 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.54 
 
 
285 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  96.14 
 
 
285 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  93.68 
 
 
285 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  93.68 
 
 
285 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  93.68 
 
 
285 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  93.68 
 
 
285 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  93.68 
 
 
285 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  93.68 
 
 
285 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  93.59 
 
 
281 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.23 
 
 
285 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  91.58 
 
 
285 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.23 
 
 
285 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.31 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.42 
 
 
292 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.36 
 
 
289 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  63.8 
 
 
293 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.34 
 
 
312 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  63.8 
 
 
293 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.16 
 
 
292 aa  377  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.16 
 
 
289 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.16 
 
 
293 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  66.9 
 
 
281 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.14 
 
 
282 aa  367  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.07 
 
 
292 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.44 
 
 
293 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  64.08 
 
 
281 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.38 
 
 
281 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  63.16 
 
 
281 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  63.38 
 
 
281 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.79 
 
 
281 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.82 
 
 
284 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0486295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.31 
 
 
314 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.31 
 
 
314 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.64 
 
 
323 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.79 
 
 
281 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.49 
 
 
281 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.64 
 
 
323 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.49 
 
 
281 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.14 
 
 
281 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.95 
 
 
294 aa  341  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0152693  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 
293 aa  328  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.464389  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.8 
 
 
313 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.76 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.06 
 
 
314 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.33 
 
 
305 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.33 
 
 
305 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.33 
 
 
293 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.7 
 
 
320 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  50 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.94 
 
 
302 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319412  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.23 
 
 
294 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  46.43 
 
 
292 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 
312 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 
294 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 
280 aa  286  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
306 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2081  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  49.29 
 
 
305 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.81 
 
 
297 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.75 
 
 
290 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
281 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.93 
 
 
274 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.72 
 
 
290 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 
273 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
269 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
277 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  44.72 
 
 
305 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
287 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 
297 aa  241  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26630  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.66 
 
 
298 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
274 aa  224  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
302 aa  222  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
273 aa  221  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
270 aa  219  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
291 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 
291 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
283 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
314 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
283 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
283 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
283 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
283 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
283 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
313 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
309 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>