More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0166 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
270 aa  526  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.91 
 
 
273 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74 
 
 
287 aa  381  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.6 
 
 
269 aa  333  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  58.8 
 
 
274 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.17 
 
 
277 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.05 
 
 
281 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.32 
 
 
280 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.51 
 
 
290 aa  318  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.31 
 
 
274 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.85 
 
 
273 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.51 
 
 
290 aa  301  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 
295 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.22 
 
 
299 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.59 
 
 
297 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  50.94 
 
 
305 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26630  carbohydrate ABC transporter membrane protein  52.65 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
291 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
293 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.92 
 
 
312 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
282 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.81 
 
 
292 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.58 
 
 
281 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  47.96 
 
 
281 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
292 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
285 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
285 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
285 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
285 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
285 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
302 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
285 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  47.12 
 
 
293 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 
293 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
285 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  43.57 
 
 
281 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  43.57 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
292 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  43.57 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  43.57 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  43.57 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  43.57 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  43.57 
 
 
285 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  43.57 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 
281 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 
281 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
281 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
281 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
305 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  44.28 
 
 
281 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
305 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  44.28 
 
 
281 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 
285 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
289 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.49 
 
 
281 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.76 
 
 
293 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
289 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  45.36 
 
 
281 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
323 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
323 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.76 
 
 
284 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0486295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
314 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
314 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36462  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.9 
 
 
293 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.464389  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
320 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  40.65 
 
 
317 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
314 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
294 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0152693  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
313 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
294 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
312 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  39.29 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
302 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319412  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 
291 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
313 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
314 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
309 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2081  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.26 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
306 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
281 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
283 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
283 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
310 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252807  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
275 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
279 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
284 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
283 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  32.95 
 
 
283 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
288 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
280 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>