More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2522 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.11 
 
 
314 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.7 
 
 
309 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
310 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252807  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
280 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  39.37 
 
 
305 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
277 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
292 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
290 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
299 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
269 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26630  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39 
 
 
298 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
274 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  37.81 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
281 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
270 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  35.29 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  35.17 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
273 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
294 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.04 
 
 
312 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.63 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
297 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
289 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
290 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
273 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
313 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  33 
 
 
285 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
285 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  33.54 
 
 
317 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
292 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.67 
 
 
285 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
285 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
285 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
285 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  32.67 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  32.67 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  32.67 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  32.67 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  32.67 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  32.67 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
285 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
274 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
291 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.12 
 
 
293 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  33.56 
 
 
281 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
314 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
293 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
285 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.53 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
293 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
323 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0486295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
314 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
314 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
281 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
293 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
292 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
281 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
281 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
320 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
281 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.84 
 
 
281 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
289 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
302 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
293 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319412  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.464389  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  31.17 
 
 
292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
297 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  33.9 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
294 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0152693  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
306 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2081  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 
305 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
283 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
284 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
283 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
283 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
283 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  29.04 
 
 
291 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
294 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
283 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
294 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
387 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.363139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
283 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  30.46 
 
 
308 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>