More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6026 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.29 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.82 
 
 
283 aa  553  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.82 
 
 
283 aa  553  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.2 
 
 
283 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.5 
 
 
283 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.2 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.5 
 
 
283 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.14 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.56 
 
 
283 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.79 
 
 
283 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.79 
 
 
283 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  57.95 
 
 
283 aa  361  9e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
283 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  60.78 
 
 
283 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  60.78 
 
 
283 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 
282 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  59.01 
 
 
284 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.06 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.38 
 
 
282 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 
283 aa  318  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  44.92 
 
 
291 aa  262  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.75 
 
 
289 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
286 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
307 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
304 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.23 
 
 
293 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 
293 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
282 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
285 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
315 aa  168  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  36.26 
 
 
281 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  36.26 
 
 
281 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
307 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0466415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
293 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  38.58 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
280 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  35.47 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
274 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
292 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.16 
 
 
315 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  34.98 
 
 
281 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
277 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  34.4 
 
 
306 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
284 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
279 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 
281 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.74 
 
 
350 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
294 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
271 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
314 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
281 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
293 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
275 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
276 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
279 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
281 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  33.71 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
279 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
281 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  32.98 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
290 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
279 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
289 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  32.98 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  32.98 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  32.98 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  32.98 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  32.98 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
279 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
279 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
314 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
295 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  33.46 
 
 
317 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
279 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
285 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
279 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
313 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
323 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
279 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
285 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
285 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
285 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
285 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>