More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2628 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
303 aa  587  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  60 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.86 
 
 
295 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.86 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00104892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1623  ABC-type sugar transport system permease component-like protein  58.04 
 
 
291 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.94 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
315 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.13 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
284 aa  236  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
306 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.530616  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
281 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
316 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0221214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
309 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.228391  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
307 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.402719  normal  0.159625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
300 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  0.11705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2339  ABC-type glucosylglycerol transport system permease protein  46.3 
 
 
349 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.50449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0466415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
313 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
317 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0715913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
387 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.363139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26150  ABC-type sugar transport system, permease component  40.37 
 
 
284 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
387 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387993  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
320 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.076259  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0787  ABC transporter membrane spanning protein  43.78 
 
 
381 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
373 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
378 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 
373 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0924165  normal  0.107351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2871  ABC alpha-glucoside transporter, inner membrane subunit AglG  45.22 
 
 
373 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1650  inner membrane ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
385 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.349838  hitchhiker  0.00000401935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
283 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
283 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
380 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.820276  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
406 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.572214  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
283 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2912  ABC transporter binding protein inner membrane protein  43.04 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.315274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
283 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
283 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 
291 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
314 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  35.74 
 
 
292 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
277 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
294 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
279 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
314 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
283 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  30.98 
 
 
317 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
283 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
294 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
312 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
290 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
305 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255354  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
305 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
293 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
297 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0531179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.33 
 
 
278 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
302 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319412  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
280 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
283 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
282 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
282 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  33.09 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
289 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
281 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
280 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  35.59 
 
 
284 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
275 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  34.41 
 
 
308 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
285 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.56 
 
 
278 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  35.9 
 
 
278 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
326 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
292 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  32.62 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
274 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  32.62 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  32.62 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  32.62 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  32.62 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  32.62 
 
 
285 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.62 
 
 
281 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.27 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>