More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3287 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.82 
 
 
283 aa  553  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.82 
 
 
283 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.2 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.2 
 
 
283 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.27 
 
 
283 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.5 
 
 
283 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.14 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.5 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.5 
 
 
283 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.14 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  56.89 
 
 
283 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 
283 aa  343  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  59.72 
 
 
283 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  59.72 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 
282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  58.66 
 
 
284 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 
283 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.06 
 
 
283 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.32 
 
 
282 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 
283 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  44.14 
 
 
291 aa  258  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 
305 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.75 
 
 
289 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
280 aa  210  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
307 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
303 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
304 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
292 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
314 aa  168  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
282 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
285 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  36.56 
 
 
281 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  36.56 
 
 
281 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.85 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
315 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  38.58 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
280 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
293 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0501667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
307 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0466415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
287 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
284 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
277 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
290 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
276 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
274 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.55 
 
 
315 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
294 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  34.59 
 
 
281 aa  158  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
292 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
292 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
271 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  34.28 
 
 
281 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.92 
 
 
281 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
281 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
275 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
295 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
290 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  33.33 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
279 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  34.36 
 
 
276 aa  152  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
270 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.35 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
279 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
314 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
279 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2402  ABC transporter membrane spanning protein  33.46 
 
 
317 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
300 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00104892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
309 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.228391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.45 
 
 
312 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
279 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
313 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
284 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
289 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 
279 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
281 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.46 
 
 
278 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
269 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
275 aa  148  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
279 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.402719  normal  0.159625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  32.2 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>