More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4588 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.46 
 
 
283 aa  533  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.93 
 
 
283 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.57 
 
 
283 aa  510  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.93 
 
 
283 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.28 
 
 
283 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.93 
 
 
283 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.57 
 
 
283 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.14 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.14 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.79 
 
 
283 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.79 
 
 
283 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.22 
 
 
282 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  56.54 
 
 
283 aa  359  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  60.78 
 
 
284 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 
283 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.12 
 
 
283 aa  338  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 
283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 
283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.06 
 
 
283 aa  334  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 
282 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.06 
 
 
283 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  44.96 
 
 
291 aa  254  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
280 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
299 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
305 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
307 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
303 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
304 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
303 aa  175  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
314 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
295 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
292 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
281 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  36.26 
 
 
281 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  36.26 
 
 
281 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
277 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  34.38 
 
 
281 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.04 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.79 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
315 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
290 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
281 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  36.84 
 
 
285 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
285 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
314 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
314 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  36.7 
 
 
281 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
313 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3083  ABC transporter, membrane permease  36.47 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.89 
 
 
281 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
279 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0785  carbohydrate ABC transporter permease  36.47 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2617  carbohydrate ABC transporter permease  36.47 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2995  carbohydrate ABC transporter permease  36.47 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3049  carbohydrate ABC transporter permease  36.47 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1995  carbohydrate ABC transporter permease  36.47 
 
 
285 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2127  maltose ABC transporter, permease protein, putative  36.47 
 
 
281 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
274 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
285 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
285 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
285 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
285 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
277 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
281 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
292 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
275 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
284 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  38.1 
 
 
269 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
285 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  0.12069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
284 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3449  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.88 
 
 
285 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000612368  normal  0.971019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
290 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
320 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
307 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0466415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
282 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
305 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.92 
 
 
293 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
281 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
295 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
307 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.402719  normal  0.159625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
280 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
271 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
294 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
309 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.228391  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
294 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
276 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
294 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
284 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
289 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>