More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7920 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
303 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 
307 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.32 
 
 
304 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.98 
 
 
286 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.65 
 
 
305 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.27 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
283 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
283 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
283 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
283 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
283 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
283 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
283 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 
291 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
283 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
289 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
283 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
283 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
283 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  36.24 
 
 
283 aa  202  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
283 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
283 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
280 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
283 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  37.25 
 
 
284 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
283 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
283 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
282 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
292 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
294 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
294 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
303 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.78 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  34.78 
 
 
281 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  35.06 
 
 
281 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  35.06 
 
 
281 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
269 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
290 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
271 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
292 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
281 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  34.66 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.16 
 
 
293 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
295 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
277 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
296 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.391762  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1623  ABC-type sugar transport system permease component-like protein  31.15 
 
 
291 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
290 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
285 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  31.88 
 
 
305 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
274 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.159934  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  28.52 
 
 
278 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
323 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319412  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.8 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.108341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.51 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.911681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2413  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.42 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.97 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9198  ABC transporter  31.08 
 
 
292 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
292 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
281 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00536554  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
281 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
281 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
275 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
279 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
285 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
315 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
280 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
285 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  29.23 
 
 
278 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
281 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
294 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
313 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
281 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
284 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
299 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
287 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 
285 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
314 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
276 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>