More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0186 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  68.03 
 
 
315 aa  364  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2413  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  66.18 
 
 
277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.68 
 
 
287 aa  345  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.31 
 
 
296 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.391762  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.96 
 
 
270 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 
303 aa  299  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0400513  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
277 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
276 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
271 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
274 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.364527  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
285 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
283 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00860  ABC-type sugar transport system, permease component  36.6 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  32.81 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
294 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
272 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.691915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
283 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 
281 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
282 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
283 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
282 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  29.58 
 
 
291 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
274 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.159934  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
284 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  36.02 
 
 
286 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
284 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  29.71 
 
 
278 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
283 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
283 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  30.71 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 
283 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 
283 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
275 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
299 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  29.88 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.88 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
292 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
271 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
283 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
274 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
300 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
283 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
281 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.28877  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
275 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
319 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
283 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  32.03 
 
 
277 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 
280 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.05 
 
 
279 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
273 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
279 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
305 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
277 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
276 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4018  carbohydrate ABC transporter permease  28.62 
 
 
279 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3573  carbohydrate ABC transporter permease  28.62 
 
 
279 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
282 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
278 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
283 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  28.4 
 
 
285 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
276 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
301 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01230  ABC-type sugar transport system, permease component  29.24 
 
 
307 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
299 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.94 
 
 
307 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
298 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
285 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
285 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
278 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
276 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
283 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
283 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.28 
 
 
280 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
279 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
275 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
294 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
291 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
304 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.97 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>