More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3817 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.5 
 
 
296 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.43 
 
 
275 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
285 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
281 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  34.15 
 
 
303 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
283 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
288 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00701283  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
279 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
298 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
294 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
294 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
279 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
277 aa  161  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
277 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
279 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
279 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
293 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
293 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  33.71 
 
 
280 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
279 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
314 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
279 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
284 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
277 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.06 
 
 
295 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
275 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
279 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
279 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
281 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
287 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.85 
 
 
297 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
279 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
279 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
279 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  34.56 
 
 
303 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
273 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
286 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.04 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
295 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
275 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  34.29 
 
 
292 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 
293 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
276 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
276 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
283 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  29.6 
 
 
293 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
277 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
273 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
271 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
279 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  34.13 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
276 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.8 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
285 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
287 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  0.0256489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
278 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.28 
 
 
278 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
275 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.84 
 
 
277 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  34.35 
 
 
281 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
282 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  30.11 
 
 
291 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
281 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
279 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.1 
 
 
283 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
304 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
277 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
283 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
279 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
280 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
280 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
274 aa  142  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.159934  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
281 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
280 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.77 
 
 
279 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
275 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
270 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.06 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  32.55 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  32.41 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>