More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1649 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.55 
 
 
279 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.19 
 
 
279 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.17 
 
 
279 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.67 
 
 
279 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.04 
 
 
279 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.31 
 
 
279 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.31 
 
 
279 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.51 
 
 
279 aa  351  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  60.79 
 
 
279 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  60.43 
 
 
279 aa  348  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
276 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00701283  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.89 
 
 
298 aa  305  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
285 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
296 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
284 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
281 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
283 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
303 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  36.4 
 
 
292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  33.22 
 
 
303 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  35.69 
 
 
301 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
276 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
298 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
288 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
304 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
283 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
271 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  30.99 
 
 
303 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  34.11 
 
 
283 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
284 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.96 
 
 
278 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
314 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
285 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
299 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
283 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
279 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
319 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
283 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
271 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
319 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
291 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.93 
 
 
295 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
294 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
282 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
293 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.95 
 
 
301 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
282 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
283 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
283 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
283 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
283 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.27 
 
 
284 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
296 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  30.34 
 
 
271 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
276 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
283 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
283 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
283 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
274 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  31.62 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.924355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
282 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
279 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
280 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000934569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
275 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
301 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
283 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
270 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
273 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal  0.0704722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
277 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0223274 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  29.35 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0023  ABC-type maltose transport system, permease component  30.18 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>