More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0088 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  534  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.3 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  69.85 
 
 
295 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  63.94 
 
 
276 aa  341  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.828471  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  60.74 
 
 
276 aa  332  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.74 
 
 
276 aa  311  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0127547  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1617  putative binding-protein-dependent transport protein  50.92 
 
 
304 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2347  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
299 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
279 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
275 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
285 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.67 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
284 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
293 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
279 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
279 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
279 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
284 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
279 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
279 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
277 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.15 
 
 
278 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
279 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
281 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
294 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
283 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
287 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
282 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
273 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
279 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
298 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
282 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
267 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
275 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
275 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.2 
 
 
301 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
275 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1058  MalG-type ABC sugar transport system permease component  34.9 
 
 
277 aa  148  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 
279 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
276 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
299 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
298 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
282 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
297 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
271 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.87 
 
 
277 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
276 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
296 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.159934  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00701283  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
287 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 
277 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
303 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
279 aa  138  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
281 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.1 
 
 
281 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
277 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
276 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000118681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  32.68 
 
 
277 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
279 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31520  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.08 
 
 
303 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.424225  normal  0.830973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
275 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.391762  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
283 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
291 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
283 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
283 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
281 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.28877  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  33.81 
 
 
281 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
291 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
283 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  33.6 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
275 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>