More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5530 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  100 
 
 
292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  67.56 
 
 
301 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  69.5 
 
 
303 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.44 
 
 
319 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.44 
 
 
319 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 
303 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.14 
 
 
314 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  48.58 
 
 
303 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.17 
 
 
298 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
285 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
275 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  35.38 
 
 
329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
281 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
293 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  36.68 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  30.95 
 
 
293 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
293 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
287 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
279 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
294 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
284 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
276 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
273 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
294 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
279 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
280 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
279 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
297 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
279 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
288 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
279 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
294 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
279 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
275 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
279 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
296 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
303 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
279 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
282 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
278 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
284 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.98 
 
 
278 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
275 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
301 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 
291 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.07 
 
 
301 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
281 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
282 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.19 
 
 
304 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  30.61 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
275 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
284 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
282 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
281 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
283 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
277 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
280 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183676  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.82 
 
 
281 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
305 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
279 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
313 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000624363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.53 
 
 
312 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
275 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
270 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
279 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.3 
 
 
277 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
311 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
300 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
279 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
283 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
291 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
287 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  0.0256489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
309 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
291 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.99 
 
 
298 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
271 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.75 
 
 
284 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.63 
 
 
276 aa  149  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  35.21 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
297 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
298 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>