More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  100 
 
 
284 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.53 
 
 
281 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
281 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.39 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
303 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
293 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
279 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  34.23 
 
 
293 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  33.8 
 
 
303 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  33.79 
 
 
301 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  31.34 
 
 
291 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
319 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
314 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
290 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
319 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
300 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
288 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.64 
 
 
297 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
277 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  35.19 
 
 
271 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
271 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
279 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
299 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
298 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
275 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
303 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
296 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  35.39 
 
 
292 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
273 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  34.93 
 
 
303 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
274 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
279 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
283 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
290 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
284 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
268 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
289 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
281 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
276 aa  148  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
275 aa  148  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
275 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0223274 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  34.55 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
275 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
279 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
279 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
311 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
299 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
279 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
285 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
298 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
273 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
280 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
280 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  35.66 
 
 
273 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
304 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
279 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  32.4 
 
 
281 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
279 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
282 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
275 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
283 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
274 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
271 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
284 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6549  sugar ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0775264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
273 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
279 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
306 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>