More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5740 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
286 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
277 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
280 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
275 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
293 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
286 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
275 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
283 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
276 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
278 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
278 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
282 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
281 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  34.93 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
279 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
278 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
275 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
283 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
319 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
289 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
283 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
253 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
305 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
271 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
255 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
273 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
319 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
275 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
281 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
273 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
278 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
306 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
275 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  31.79 
 
 
275 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.64 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.67 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
278 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
280 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
276 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.87 
 
 
293 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
281 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
280 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
280 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
291 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
299 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
291 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
277 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
311 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
277 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
288 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
289 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
289 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
277 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
277 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
289 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  32.18 
 
 
275 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
275 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  32.18 
 
 
275 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.07 
 
 
298 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
293 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
277 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.8 
 
 
282 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
273 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
277 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
298 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
280 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
276 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  29.84 
 
 
277 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
277 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
288 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.56 
 
 
283 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3582  hypothetical protein  32.21 
 
 
278 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.928396  normal  0.804079 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
276 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.96 
 
 
278 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
304 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.482909  normal  0.394825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>