More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2981 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
319 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.79 
 
 
319 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  54.64 
 
 
303 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.95 
 
 
314 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  48.37 
 
 
301 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  53.1 
 
 
292 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.31 
 
 
298 aa  262  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  43.23 
 
 
303 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
303 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
285 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  31.58 
 
 
329 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
275 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
284 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 
293 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  29.87 
 
 
293 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
309 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
279 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
279 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
279 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
279 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
288 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
280 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183676  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
297 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
281 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  33.09 
 
 
276 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
293 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
275 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
279 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  28.24 
 
 
291 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
273 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.72 
 
 
304 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
276 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
311 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
292 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.35 
 
 
307 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
305 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
301 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  32.88 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  34.31 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
287 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
294 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.71 
 
 
281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 
278 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
271 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
287 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  0.0256489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
303 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
294 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.3 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  30.93 
 
 
277 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
279 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1617  putative binding-protein-dependent transport protein  29.06 
 
 
304 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.2 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 
277 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
297 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
294 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 
291 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 
291 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
279 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
272 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3987  putative sugar ABC transporter (permease protein)  30.91 
 
 
282 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  31.87 
 
 
272 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  32.31 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.67 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
295 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
297 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
279 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
306 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
315 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>