More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5332 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
297 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  56.6 
 
 
283 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  57.35 
 
 
273 aa  317  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59 
 
 
261 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.58 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.23 
 
 
272 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  45.7 
 
 
304 aa  262  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
298 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  48.8 
 
 
291 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  50.67 
 
 
297 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.08 
 
 
280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.99 
 
 
280 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 
277 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.55 
 
 
302 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
284 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.7 
 
 
304 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.65 
 
 
306 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.06 
 
 
303 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
297 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
296 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
306 aa  215  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
275 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
268 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  38.31 
 
 
278 aa  205  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.84 
 
 
278 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.67 
 
 
299 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
297 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
294 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 
297 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
295 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.74 
 
 
295 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  41.02 
 
 
278 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  41.02 
 
 
278 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
275 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
270 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
279 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
274 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
281 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
297 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
284 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
270 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.81 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
269 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
295 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
271 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000194486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  38.02 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  35.38 
 
 
277 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
310 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
311 aa  178  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
277 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
246 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 
277 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
300 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
301 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.78 
 
 
291 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
274 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
285 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
275 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
290 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  36.62 
 
 
295 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
294 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
296 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
276 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
315 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
270 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
318 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000451963  hitchhiker  0.00127985 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
297 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
273 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  31.54 
 
 
306 aa  168  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
280 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.96 
 
 
279 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
283 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
390 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
271 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
293 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.57 
 
 
296 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  34.35 
 
 
276 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
324 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  34.34 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0826  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
279 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>