More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1508 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.36 
 
 
280 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.81 
 
 
298 aa  351  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.27 
 
 
277 aa  328  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  56.63 
 
 
291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
279 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  51.66 
 
 
304 aa  291  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  55.06 
 
 
283 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.51 
 
 
284 aa  288  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  54.21 
 
 
273 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  53.76 
 
 
297 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.08 
 
 
297 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
272 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
298 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.6 
 
 
304 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
298 aa  225  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
297 aa  224  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
268 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
306 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 
297 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
303 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
297 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
296 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
294 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
270 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.41 
 
 
299 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  38.11 
 
 
278 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  36.9 
 
 
292 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
270 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
275 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
310 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
295 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  35.85 
 
 
277 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
275 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
271 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
269 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  35.98 
 
 
294 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
275 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
278 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
294 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  38.15 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 
277 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
271 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
390 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
284 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
283 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
274 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
293 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 
295 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
295 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
277 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  33.09 
 
 
306 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
300 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
290 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
290 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  36.06 
 
 
269 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
275 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.81 
 
 
350 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
294 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
282 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 
290 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  37.08 
 
 
278 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.06 
 
 
305 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
274 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
319 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
285 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  36.7 
 
 
278 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 
277 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
271 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
274 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
349 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.470539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
292 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.07 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  35.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>