More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0401 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.03 
 
 
302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  65.78 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.22 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.26 
 
 
306 aa  318  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  53.63 
 
 
283 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.7 
 
 
303 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  56.65 
 
 
273 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.88 
 
 
297 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
279 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 
298 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.74 
 
 
306 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  45.36 
 
 
304 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.63 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  45.61 
 
 
291 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
280 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
277 aa  222  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
275 aa  222  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
261 aa  222  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  44.52 
 
 
297 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
275 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 
297 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 
297 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.8 
 
 
299 aa  189  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  40.16 
 
 
278 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
270 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
294 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
283 aa  182  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
269 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 
278 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
270 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
295 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
246 aa  168  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
277 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
294 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
297 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
278 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
283 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
275 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.85 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.57 
 
 
306 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
270 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
298 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
390 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  33.96 
 
 
294 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.07 
 
 
305 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
279 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  34.07 
 
 
277 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  36.02 
 
 
280 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
274 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  40.87 
 
 
278 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
276 aa  158  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
275 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  40.43 
 
 
278 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.34 
 
 
277 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
311 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
298 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
290 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
324 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
277 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
273 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
281 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
281 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
271 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
274 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.63 
 
 
295 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.83 
 
 
305 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
271 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
271 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
304 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
314 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.023503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.74 
 
 
302 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
275 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.44 
 
 
297 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
300 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
295 aa  148  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
271 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  37.55 
 
 
287 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 
277 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  33.85 
 
 
286 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
296 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  35.66 
 
 
278 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10970  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.47 
 
 
314 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
279 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>