More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10970  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 
283 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5004  sugar ABC transporter permease  58.48 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0638088  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.79 
 
 
304 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  54.51 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.81 
 
 
304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.4 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.378357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 
314 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.023503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  50.2 
 
 
285 aa  259  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  36.74 
 
 
277 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
282 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.64 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
281 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.04 
 
 
277 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
271 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 
271 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.45 
 
 
306 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
297 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.99 
 
 
279 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  35.51 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  35.92 
 
 
263 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.86 
 
 
276 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.21 
 
 
277 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
275 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1938  putative permease protein of sugar ABC transporter  36.59 
 
 
274 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
246 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.35 
 
 
297 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  35.16 
 
 
278 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
301 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
294 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
274 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
273 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 
275 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
302 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
284 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
284 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
301 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.92 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
295 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.87 
 
 
295 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
280 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
299 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
277 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
275 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
297 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
275 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
300 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
272 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
296 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
286 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
285 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
308 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
297 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
284 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
279 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
273 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
283 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.22 
 
 
305 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
312 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
271 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
302 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
280 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
291 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
303 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
268 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
275 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
270 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
269 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
299 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
297 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
301 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
300 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
301 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  34.8 
 
 
293 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
304 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
310 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33 
 
 
319 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
293 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01230  ABC-type sugar transport system, permease component  30.55 
 
 
307 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
274 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 
269 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
275 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  32.45 
 
 
280 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
272 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
293 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  31.46 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>