More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2735 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.65 
 
 
276 aa  361  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  45.72 
 
 
292 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.94 
 
 
297 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
269 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
278 aa  228  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  43.56 
 
 
297 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
297 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
274 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
275 aa  218  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
278 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
297 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  41.64 
 
 
283 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
281 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  40.15 
 
 
291 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
275 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
279 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
273 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
278 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.392482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.35 
 
 
273 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  40.38 
 
 
295 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  44.16 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  40.08 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
283 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
294 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  42.42 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  39.62 
 
 
278 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
295 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
272 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
310 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
270 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
275 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
336 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
280 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
296 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
270 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
275 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
270 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  42.42 
 
 
273 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000194486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.55 
 
 
281 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
297 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
301 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  39.39 
 
 
286 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.69 
 
 
302 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.58 
 
 
296 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 
277 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
280 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
281 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
298 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  38.65 
 
 
306 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
292 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.43 
 
 
297 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
280 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  38.91 
 
 
290 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
271 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  38.1 
 
 
271 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
279 aa  185  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
274 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.92 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  35.38 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  36.19 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
300 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.84 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
275 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
276 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
294 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
315 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
298 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
284 aa  178  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  38.67 
 
 
278 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
277 aa  178  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 
288 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
295 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  35.63 
 
 
294 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  38.31 
 
 
277 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  35.45 
 
 
304 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15080  ABC-type sugar transport system, permease component  37.6 
 
 
274 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  37.97 
 
 
263 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
271 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  38.43 
 
 
278 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
283 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0738  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
270 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
296 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
270 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>