More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6586 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
269 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
268 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  47.31 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
278 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
275 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  43.14 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  43.43 
 
 
297 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  43.2 
 
 
278 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 
294 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
297 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
281 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
297 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 
296 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
275 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
246 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
298 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  40.16 
 
 
278 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  43.3 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
303 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
311 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  38.98 
 
 
277 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
273 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
284 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15080  ABC-type sugar transport system, permease component  38.49 
 
 
274 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.92 
 
 
299 aa  191  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
279 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
297 aa  188  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  39.41 
 
 
278 aa  188  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
288 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 
303 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
270 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0738  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
270 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.22 
 
 
302 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
272 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  39.03 
 
 
278 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 
290 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
299 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  38.52 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
270 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.29 
 
 
274 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  38.17 
 
 
277 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  36.44 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
289 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 
281 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
279 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
294 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
300 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
298 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.07 
 
 
297 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.01 
 
 
273 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.11 
 
 
279 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  37.85 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
275 aa  178  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
277 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
270 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.03 
 
 
275 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
281 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
273 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
278 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
278 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
283 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  38.31 
 
 
283 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
283 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.11 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.73 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  35.66 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.55 
 
 
278 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.65 
 
 
295 aa  172  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  37.92 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.4 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
276 aa  171  9e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
271 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.69 
 
 
350 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
301 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>