More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0840 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  100 
 
 
273 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  78.31 
 
 
283 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.35 
 
 
297 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.25 
 
 
279 aa  315  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
298 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  54.24 
 
 
304 aa  288  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.12 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.85 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 
298 aa  281  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.92 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.65 
 
 
298 aa  271  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  54.61 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  50.74 
 
 
291 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
297 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.21 
 
 
280 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.21 
 
 
280 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.55 
 
 
284 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.79 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.86 
 
 
304 aa  237  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.62 
 
 
306 aa  230  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
306 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
275 aa  225  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
296 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
268 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
275 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.56 
 
 
299 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  37.16 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  39.62 
 
 
297 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
276 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 
292 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
278 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  34.98 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
297 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
277 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
270 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
294 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
295 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
270 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  35.71 
 
 
280 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  39.44 
 
 
278 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 
278 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
269 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  34.59 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
294 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
390 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
271 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
270 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
271 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.05 
 
 
296 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  37.13 
 
 
272 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
272 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
291 aa  158  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
279 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
274 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
324 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
282 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
273 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
274 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
300 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
290 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
284 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
271 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
298 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.15 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
281 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
310 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
274 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  33.6 
 
 
286 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
301 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
283 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
276 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  34.77 
 
 
278 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 
295 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.33 
 
 
277 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
283 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
278 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
295 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  32.95 
 
 
294 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  30.71 
 
 
308 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  37.97 
 
 
287 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
277 aa  148  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
276 aa  148  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
301 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
295 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  35.94 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>