More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0936 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  100 
 
 
304 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.38 
 
 
298 aa  348  8e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  52.98 
 
 
297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  54.24 
 
 
273 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.31 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.72 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  53.31 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  49.65 
 
 
283 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
279 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.03 
 
 
280 aa  271  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.66 
 
 
280 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 
297 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.55 
 
 
272 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
298 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.77 
 
 
304 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
303 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
306 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 
306 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
275 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
296 aa  205  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
261 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.42 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  35.97 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
297 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
268 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  35.79 
 
 
306 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.84 
 
 
278 aa  168  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  36.4 
 
 
292 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
276 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
283 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
297 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
294 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.7 
 
 
296 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
270 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
274 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  38.62 
 
 
281 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
278 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
279 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.57 
 
 
298 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
246 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 
295 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.34 
 
 
302 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
281 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
275 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  32.94 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
271 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.32 
 
 
275 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  36.75 
 
 
287 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
290 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
280 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.06 
 
 
295 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
277 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
294 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
273 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
283 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
274 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
295 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
275 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
270 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
269 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.23 
 
 
279 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
282 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
271 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.56 
 
 
271 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  35.9 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  33.98 
 
 
276 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  29.35 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
275 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.24 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  30.45 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.46 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
293 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  34.88 
 
 
278 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3958  putative sugar transporter, permease protein  33.11 
 
 
300 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
274 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
277 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
271 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 
276 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 
278 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
301 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1444  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.98 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>