More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2613 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 
298 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.08 
 
 
273 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
298 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
302 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  46.76 
 
 
283 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  51.82 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  45.52 
 
 
304 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
261 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
272 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
275 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
279 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.57 
 
 
303 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  45.3 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 
306 aa  220  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 
277 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
284 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
294 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
296 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
297 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  45.15 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.8 
 
 
299 aa  191  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
297 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
268 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
280 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
275 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
269 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
280 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  36.9 
 
 
278 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.5 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  33.55 
 
 
306 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
277 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
295 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
271 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
294 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
290 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
270 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
271 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  32.57 
 
 
277 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
284 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
276 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
283 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  37.1 
 
 
280 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  32.85 
 
 
286 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.21 
 
 
304 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 
277 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.39 
 
 
271 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
311 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
324 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
271 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.31 
 
 
277 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
301 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
246 aa  152  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
301 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
273 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
390 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
295 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
277 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 
281 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
274 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
270 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
285 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  27.87 
 
 
308 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  32.47 
 
 
273 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.58 
 
 
302 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.91 
 
 
296 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
274 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  32.41 
 
 
288 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
281 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 
277 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
278 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
285 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
283 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 
273 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.7 
 
 
279 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
275 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
299 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 
278 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  32.1 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  32.1 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  32.1 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  32.1 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  37.16 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>